I Epson R3000 används patroner som rymmer 25,9 ml bläck, jämfört med de 11,4 ml som finns i Epson R2880. Bläcket som används är fortfarande Epson K3 Vivid Magenta, men man har lyckats minska bläckdropparnas storlek från 3 picoliter till 2 picoliter. Andra förbättringar på den nya skrivaren är det inbyggda trådlösa nätverket och att man kan växla mellan Photo Black och Matte Black automatiskt. 

Till vänster syns mönstret från Epson R3000, med den nya 2 picloliter droppstorleken. Till höger syns mönstret från Epson R2880, med 3 picoliters droppstorlek. De mindre dropparna ger en bättre återgivning av till exempel hudstruktur.

Epson har också förbättrat pappersmatningen, framförallt när man använder tjockare konstpapper. Sådana papper matas nu framifrån, vilket gör det lättare att placera skrivaren i trängre utrymmen. Skrivaren kan också hantera rullpapper och utskrifter på cd/DVD. Man kan också skriva ut på styva material, eftersom det finns en rak pappersbana som ett alternativ.

I och med den inbyggda färgskärmen kan alla inställningar göras på ett enklare sätt än på tidigare skrivare. Med den inbyggda manualen kan man få hjälp med alla specialinställningar som krävs.